RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531983.1

RBBP4-219, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 2

Gene RBBP4, Length 473 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-219	ENST00000531983	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		A0A1W2PPE2	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		A0A1W2PR64	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		A0A1W2PRV1	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		A0A1W2PRX2	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	GLCE	O94923	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TXNDC12	O95881	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	NPPA	P01160	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SPARC	P09486	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZNF823	P16415	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FAH	P16930	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	POU1F1	P28069	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	HSD11B1	P28845	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	GZMM	P51124	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	BMX	P51813	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CAPZA1	P52907	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DLX1	P56177	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	LGALS4	P56470	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	IL5RA	Q01344	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZNF92	Q03936	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SNCB	Q16143	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	AANAT	Q16613	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	STUM	Q69YW2	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FN3K	Q9H479	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	F2RL2	O00254	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DCTN6	O00399	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	IMPA2	O14732	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FFAR1	O14842	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CHST1	O43916	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	FCN3	O75636	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SERPINA1	P01009	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CD28	P10747	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SLC2A1	P11166	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SELL	P14151	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	IGLL1	P15814	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	COX7A1	P24310	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DDOST	P39656	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	SLC15A1	P46059	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	CX3CR1	P49238	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	PRKX	P51817	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DGCR6	Q14129	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983		Q8N7P7	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBBP4-219	ENST00000531983	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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