RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TEAD3	Q99594	435 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FOXC2	Q99958	501 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A087WWL8	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	PFDN1	O60925	122 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	RGS6	P49758	472 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	RFK	Q969G6	155 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM100	Q9NV29	134 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A087WXM4	84 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	P2RY10	O00398	339 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	AMY1A	P04745	511 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF35	P13682	527 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB1C	Q92928	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	COQ7	Q99807	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A1B0GVI7	797 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846		H0YL77	283 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	APOC1	P02654	83 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	HEXA	P06865	529 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GAA	P10253	952 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SOX2	P48431	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC25A1	P53007	311 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF92	Q03936	586 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	MED22	Q15528	200 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	DOK1	Q99704	481 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	NCR1	O76036	304 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	OR2C1	O95371	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	PRKACA	P17612	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GABRA2	P47869	451 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	MTNR1A	P48039	350 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	POU3F4	P49335	361 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	CDK5	Q00535	292 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLVS1-205	ENST00000519846	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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