RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8S1Q8NH09 359 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM57AQ8TBR7 257 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51E1Q8TCB6 317 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SENP8Q96LD8 212 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IKZF2Q9UKS7 526 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HES2Q9Y543 173 aa-0.61□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCE1LA8MT33 242 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F5H5T6 163 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYNC1I1O14576 645 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD51CO43502 376 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCGNO76038 276 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT2B4P06133 528 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGA4P0DJD7 388 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGA3P0DJD8 388 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGA5P0DJD9 388 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTR1DP28221 377 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MERTKQ12866 999 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDK4Q16654 411 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC184Q52MB2 194 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HHATQ5VTY9 493 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMN1Q8IY45 258 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CBR4Q8N4T8 237 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPV1Q8NER1 839 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2M7Q8NG81 312 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T34Q8NGX1 318 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUBPLQ8TB37 319 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFRSF14Q92956 283 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RDH12Q96NR8 316 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC19A3Q9BZV2 496 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TXNIPQ9H3M7 391 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIGUQ9H490 435 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COQ10BQ9H8M1 238 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NT5MQ9NPB1 228 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGS18Q9NS28 235 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETNK2Q9NVF9 386 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-0.62□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GTI1 187 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNTNA6NMZ2 147 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRPO00591 440 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLPP3O14495 311 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC22BO75396 215 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXorf1O96002 111 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERPINE2P07093 398 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A6P0DMU7 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A5P0DMU8 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A7P0DMV0 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAX6P26367 422 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC6A1P30531 599 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYCNOSP40205 109 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SP4Q02446 784 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BST1Q10588 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAB1Q13506 487 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A1Q5HYN5 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10W1Q8NGF6 305 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T3Q8NH03 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CT45A3Q8NHU0 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STMN2Q93045 179 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTN2A3PQ96KV6 586 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R36Q96LQ0 422 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITX2Q99697 317 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5SQ99766 215 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNCP24821 2201 aa-0.63□□□□□ -2.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms