RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 SEC22AQ96IW7 307 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BTF3L4Q96K17 158 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 C4orf36Q96KX1 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CMC2Q9NRP2 79 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 KIAA1456Q9P272 454 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FUT9Q9Y231 359 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ARL5AQ9Y689 179 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PIEZO1Q92508 2521 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 A0A087WUU8 490 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MSGN1A6NI15 193 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF727A8MUV8 499 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 VSTM5A8MXK1 200 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ALG1L2C9J202 215 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 C22orf46C9J442 243 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CORTO00230 105 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SOCS6O14544 535 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PIN1P1O15428 100 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FCMRO60667 390 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SCGB1D1O95968 90 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 NPIPA8P0DM63 369 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR13C7P0DN81 318 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CTSAP10619 480 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FAHP16930 419 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 GZMHP20718 246 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CCNOP22674 350 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TNFSF4P23510 183 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FPR2P25090 351 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ADORA2BP29275 332 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LTBRP36941 435 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CEACAM3P40198 252 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 KHKP50053 298 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RAB28P51157 221 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BLKP51451 505 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 IL13RA1P78552 427 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HLA-DRB3P79483 266 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 COL10A1Q03692 680 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LTBQ06643 244 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ST3GAL3Q11203 375 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PPP1R1AQ13522 171 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 IHHQ14623 411 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CHST9Q7L1S5 443 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF429Q86V71 674 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BATF2Q8N1L9 274 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MTURNQ8N3F0 131 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR5B3Q8NH48 314 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PTX4Q96A99 478 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ARRDC3Q96B67 414 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MOAP1Q96BY2 351 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 DDIT4LQ96D03 193 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF479Q96JC4 524 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 GPR174Q9BXC1 333 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SGK2Q9HBY8 427 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CD207Q9UJ71 328 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR5B21A6NL26 309 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 J3QLW9 94 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms