RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8S1	Q8NH09	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM46B	Q96A09	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TAAR6	Q96RI8	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CHIA	Q9BZP6	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DIABLO	Q9NR28	239 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GVI7	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SULT1C2	O00338	296 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SSNA1	O43805	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	NME2P1	O60361	137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAF2	O60831	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CBR3	O75828	277 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC6A	O75865	159 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2A4	O95047	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	BPNT1	O95861	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CD2	P06729	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TPO	P07202	933 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MELTF	P08582	738 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CSF1	P09603	554 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GNB3	P16520	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MSR1	P21757	451 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	NME2	P22392	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DNASE1	P24855	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ACKR3	P25106	362 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAL	P38405	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	HTR2B	P41595	481 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MEOX1	P50221	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GFRA1	P56159	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PER3	P56645	1201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	H2BFS	P57053	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	AP3S2	P59780	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DHODH	Q02127	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PLGLB1	Q02325	96 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TLE1	Q04724	770 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2V2	Q15819	145 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2M7	Q8NG81	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	THRSP	Q92748	146 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	PTX4	Q96A99	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SGK3	Q96BR1	496 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	MED30	Q96HR3	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2A7	Q96R45	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	GON7	Q9BXV9	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	BANF2	Q9H503	90 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	EMC3	Q9P0I2	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB22A	Q9UL26	194 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms