RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 REEP6Q96HR9 211 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PGAM5Q96HS1 289 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8B2Q96RD0 313 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TBX15Q96SF7 602 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CCL13Q99616 98 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 COPS3Q9UNS2 423 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 A6NLC8 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC30A6NM36 301 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 IFNL4K9M1U5 179 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 XRCC2O43543 280 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 E2F6O75461 281 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PLATP00750 562 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 H2BFMP0C1H6 154 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SELLP14151 372 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ALOX5APP20292 161 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 HSD11B1P28845 292 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CRISP1P54107 249 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ARF6P62330 175 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 BAMBIQ13145 260 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 APOFQ13790 326 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 FLOT2Q14254 428 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8B8Q15620 311 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TIGD6Q17RP2 521 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SHFQ7M4L6 423 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PARP8Q8N3A8 854 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OTOSQ8NHW6 89 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC29Q8WV35 223 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PIGCQ92535 297 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ERGIC1Q969X5 290 aa6.05□□□□□ -1.44
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PRPF4B-208ENST00000490653 TEAD3Q99594 435 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 MRI1Q9BV20 369 aa6.05□□□□□ -1.44
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PRPF4B-208ENST00000490653 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CLN8Q9UBY8 286 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 VWFP04275 2813 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OOEPA6NGQ2 149 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 DVL1O14640 695 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CDIPTO14735 213 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKYO43930 277 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 FSTL3O95633 263 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 HMGN1P05114 100 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 LYNP07948 512 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 ANXA8P13928 327 aa6.04□□□□□ -1.44
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PRPF4B-208ENST00000490653 HOXA5P20719 270 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 OMGP23515 440 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PRTN3P24158 256 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 CFHR2P36980 270 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00310P59036 64 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 EFNB1P98172 346 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 BNIP1Q12981 228 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PRDX4Q13162 271 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 SNAPC1Q16533 368 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 FAHD1Q6P587 224 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 WDR82Q6UXN9 313 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF4B-208ENST00000490653 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.04□□□□□ -1.44
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