RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 FMO2Q99518 471 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PPA2Q9H2U2 334 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 NMRAL1Q9HBL8 299 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC40A1Q9NP59 571 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.02□□□□□ -2.095e-12■■■■■ 56.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 H3BQV1 296 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 RTL8CO15255 209 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 FCMRO60667 390 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 NMUP48645 174 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 TFDP3Q5H9I0 405 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR11G2Q8NGC1 345 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10G9Q8NGN4 311 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10G6Q8NH81 332 aa2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM172AQ8WUF8 416 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 TRIB3Q96RU7 358 aa2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
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RABGGTB-211ENST00000489450 PAX5Q02548 391 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 EBI3Q14213 229 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 GGTLC2Q14390 218 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 GNMTQ14749 295 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-211ENST00000489450 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
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