RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 C10orf35Q96D05 121 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB39BQ96DA2 213 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 C4orf36Q96KX1 117 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHST5Q9GZS9 411 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 AMBNQ9NP70 447 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 DYSFO75923 2080 aa6.97□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZFHX3Q15911 3703 aa6.96□□□□□ -1.29
TRAPPC3-206ENST00000469757 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRRM5B3KS81 715 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 B4DSR2 109 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM157AC9JC47 383 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 H0YHG0 523 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 LHBP01229 141 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF12P17014 697 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MYF6P23409 242 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 THBS2P35442 1172 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIPPLY3P57055 190 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR12D2P58182 307 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MPPED2Q15777 294 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 AVPI1Q5T686 147 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR82Q6UXN9 313 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 COMMD2Q86X83 199 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR8S1Q8NH09 359 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52N1Q8NH53 320 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TECTBQ96PL2 329 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAL3ST1Q99999 423 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MICU1Q9BPX6 476 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNF7Q9UBF6 113 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GVI7 797 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM212A6NML5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIAL4DF5H284 164 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 P2RY10O00398 339 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSMBP08118 114 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 HTR1AP08908 422 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MPZP25189 248 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PSMB10P40306 273 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETV1P50549 477 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GNG3P63215 75 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CSNK2BP67870 215 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 MVKQ03426 396 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC58Q4VC31 144 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNLSQ5VYX0 342 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM166AQ6J272 317 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 UTS2BQ765I0 119 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR51F2Q8NH61 342 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PP6455Q8WZ26 134 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TREM2Q9NZC2 230 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.95□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms