RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 SPATA24Q86W54 205 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 LIPHQ8WWY8 451 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 DDIT4LQ96D03 193 aa4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.96□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.96□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.96□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF175Q9Y473 711 aa4.96□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 H0YC42 278 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 PATE4P0C8F1 98 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 RIGQ13278 110 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 TRAM2Q15035 370 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 IGFBP7Q16270 282 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 OR10D3Q8NH80 312 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 NCKAP5O14513 1909 aa4.95□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.94□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 SULT2B1O00204 365 aa4.94□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 IGLV2-11P01706 119 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 FCER2P06734 321 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 STSP08842 583 aa4.94□□□□□ -1.62
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PRPF4B-204ENST00000466185 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 UQCRFS1P47985 274 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 UGT2B15P54855 530 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 CARD18P57730 90 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 SMIM11AP58511 58 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 SPIBQ01892 262 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 GK3PQ14409 553 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.94□□□□□ -1.62
PRPF4B-204ENST00000466185 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.94□□□□□ -1.62
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