RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPNQ5VXI9 398 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF826PQ6ZT77 177 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD8Q6ZWB6 473 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 C8orf4Q9NR00 106 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ENPP5Q9UJA9 477 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 COL6A5A8TX70 2615 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 OOEPA6NGQ2 149 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 C3orf80F5H4A9 247 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFA2O43678 99 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 CD80P33681 288 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 PITPNBP48739 271 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 RCN1Q15293 331 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR86Q86TI4 376 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 GCSAMQ8N6F7 178 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC29Q8WV35 223 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5P3Q8WZ94 311 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF170Q96K19 258 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 C7orf69Q9H7B7 122 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 CLN8Q9UBY8 286 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 METRNQ9UJH8 293 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-205ENST00000466097 DAPL1A0PJW8 107 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC16A6O15403 523 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 LHBP01229 141 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 FAHP16930 419 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 GABRB1P18505 474 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 NPY4RP50391 375 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 GNG3P63215 75 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CSNK2BP67870 215 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CEACAM21Q3KPI0 293 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF684Q5T5D7 378 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR82Q6UXN9 313 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 DOK3Q7L591 496 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT74Q7RTS7 529 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CATSPERDQ86XM0 798 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 PACRGLQ8N7B6 248 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 TLNRD1Q9H1K6 362 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 GNG8Q9UK08 70 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1B0GVI7 797 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5B21A6NL26 309 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 P2RY10O00398 339 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CDIPTO14735 213 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 NRASP01111 189 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CFHR2P36980 270 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 GPM6AP51674 278 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ACTA2P62736 377 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ACTG2P63267 376 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF85Q03923 595 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF91Q05481 1191 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 MICBQ29980 383 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 TP53I3Q53FA7 332 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP78Q5JTW2 689 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 MOB3CQ70IA8 216 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5A2Q8NGI9 324 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 NANPQ8TBE9 248 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 HPSE2Q8WWQ2 592 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 RORBQ92753 470 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 MRI1Q9BV20 369 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ADI1Q9BV57 179 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 AASSQ9UDR5 926 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 INSIG2Q9Y5U4 225 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 V9GYS6 101 aa12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms