RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 TAAR9Q96RI9 348 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 RNF212BA8MTL3 300 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 H7C1Q1 480 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 CTAG2O75638 210 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 NKX2-2O95096 273 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 CD1AP06126 327 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 CD37P11049 281 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 NXPH1P58417 271 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PCK2Q16822 640 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 GNRHR2Q96P88 292 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 FOXC1Q12948 553 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 ZNF266Q14584 549 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 OR51F2Q8NH61 342 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 HAS2Q92819 552 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 COX14Q96I36 57 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 MIOXQ9UGB7 285 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 A0A0U1RQK1 487 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 C5orf49A4QMS7 147 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 K7EQS6 105 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 DEGS1O15121 323 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 MT-CO3P00414 261 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 NDUFB7P17568 137 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 CALCRP30988 508 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 KCNJ3P48549 501 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 RDH5Q92781 318 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 NRTNQ99748 197 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.977e-6■□□□□ 11
TNS1-209ENST00000446688 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 TUSC2O75896 110 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 SLC25A4P12235 298 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 AVPR2P30518 371 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 FCGR2CP31995 323 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 FABP6P51161 128 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 MRGPREQ86SM8 312 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 SLC39A7Q92504 469 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TNS1-209ENST00000446688 PSME4Q14997 1843 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 A0A087WUJ7 227 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 LRRC30A6NM36 301 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 AP4M1O00189 453 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 HS3ST1O14792 307 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 SPINT2O43291 252 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 OR13C7P0DN81 318 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 B4GALT1P15291 398 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 SLC25A1P53007 311 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 LGALS4P56470 323 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 IL11RAQ14626 422 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 SHBQ15464 509 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 TAF9Q16594 264 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 PLPP5Q8NEB5 264 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 NPTNQ9Y639 398 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 A0A0B4J2E0 115 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 A0A1B0GX12 115 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 FAM157BP0CG42 384 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 KITLGP21583 273 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 TLE4Q04727 773 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 OR8G1Q15617 311 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 TCTN1Q2MV58 587 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 FAM209BQ5JX69 171 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TNS1-209ENST00000446688 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms