RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	RNF7	Q9UBF6	113 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR5B21	A6NL26	309 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241		J3QLW9	94 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV2-5	P01817	119 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	HTR1A	P08908	422 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF19	P17023	458 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	MYL12A	P19105	171 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PCMT1	P22061	227 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TGM4	P49221	684 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	MVK	Q03426	396 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ8	Q15842	424 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	WDR38	Q5JTN6	314 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM42	Q69YG0	159 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	GAL3ST1	Q99999	423 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	SOX7	Q9BT81	388 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TREM2	Q9NZC2	230 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	P2RY10	O00398	339 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	SYT7	O43581	403 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	NRAS	P01111	189 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC159	P0C7I6	412 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LIMS3	P0CW19	117 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LIMS4	P0CW20	117 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PMEL	P40967	661 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	GNG3	P63215	75 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF154	Q13106	437 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZMYND11	Q15326	602 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	MPPED2	Q15777	294 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	AVPI1	Q5T686	147 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR52N1	Q8NH53	320 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PIGC	Q92535	297 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ISPD	A4D126	451 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241		A6NLC8	198 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM212	A6NML5	194 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4D	F5H284	164 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	WNT9B	O14905	357 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA2	O43678	99 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	FAH	P16930	419 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	IL2RG	P31785	369 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	KIR3DL2	P43630	455 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF404	Q494X3	552 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR51F2	Q8NH61	342 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PP6455	Q8WZ26	134 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	GGH	Q92820	318 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	RNF170	Q96K19	258 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	MIOX	Q9UGB7	285 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	HHLA2	Q9UM44	414 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	LGALS8	O00214	317 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
PTPA-222	ENST00000445241	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44

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