RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TMEM163Q8TC26 289 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ST8SIA4Q92187 359 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR8B4Q96RC9 309 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TBX5Q99593 518 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CCL13Q99616 98 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PKP2Q99959 881 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 APOL4Q9BPW4 351 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MICU1Q9BPX6 476 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RGCCQ9H4X1 137 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DVL1O14640 695 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 AKR7A2O43488 359 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CIB2O75838 187 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PLATP00750 562 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SELLP14151 372 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 AMY2BP19961 511 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CPT2P23786 658 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KCNJ8Q15842 424 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 WDR38Q5JTN6 314 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CEP78Q5JTW2 689 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DOK3Q7L591 496 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SSX6Q7RTT6 188 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MROQ9BYG7 248 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GPR84Q9NQS5 396 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TMEM89A2RUT3 159 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SRRM5B3KS81 715 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RHBDL1O75783 438 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CST4P01036 141 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAHP16930 419 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CFPP27918 469 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 CFHR2P36980 270 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NPY4RP50391 375 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GPM6AP51674 278 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 EFNB1P98172 346 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 IL5RAQ01344 420 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ROM1Q03395 351 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 BAMBIQ13145 260 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 IKZF1Q13422 519 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 MICBQ29980 383 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ASRGL1Q7L266 308 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RNF170Q96K19 258 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TBX15Q96SF7 602 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A6NIN4 97 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF879B4DU55 563 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 H3BSH0 61 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TTRP02766 147 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 FCGR1AP12314 374 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MMP9P14780 707 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 FTMTQ8N4E7 242 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A0U1RQV5 110 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TMEM210A6NLX4 147 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNF732B4DXR9 585 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA2O43678 99 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms