RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC182	A6NF36	153 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TOX4	O94842	621 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	AMY2B	P19961	511 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HCCS	P53701	268 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	POU4F2	Q12837	409 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDX4	Q13162	271 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	APOF	Q13790	326 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	SNAPC1	Q16533	368 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf87	Q6PH81	154 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	WDFY2	Q96P53	400 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TEAD3	Q99594	435 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	MICU1	Q9BPX6	476 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX12	Q9BXU0	123 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCB9	Q9NP78	766 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GW55	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOD1	A6NK06	481 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTD	P32321	178 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BNIP1	Q12981	228 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR38	Q5JTN6	314 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT77	Q7Z794	578 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FGFRL1	Q8N441	504 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SEH1L	Q96EE3	360 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL13	Q99616	98 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PKP2	Q99959	881 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM206A	Q9NX38	181 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX4	Q9UBX2	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0U1RQV5	110 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR32	B1ATL7	298 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TGM4	P49221	684 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ESRRG	P62508	458 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EFNB1	P98172	346 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ROM1	Q03395	351 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	STUM	Q69YW2	141 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6YL49	198 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NOX4	Q9NPH5	578 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	COPS3	Q9UNS2	423 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GUS0	222 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKY	O43930	277 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OMG	P23515	440 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ARF6	P62330	175 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PDCD1	Q15116	288 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6AP1	Q15904	470 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ST8SIA4	Q92187	359 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGC	Q92535	297 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8B4	Q96RC9	309 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MRO	Q9BYG7	248 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KPTN	Q9Y664	436 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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