RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB18Q9NP72 206 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIGLEC7Q9Y286 467 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DBX1A6NMT0 343 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST8SIA5O15466 376 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIRT5Q9NXA8 310 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPQ1 181 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNFSF15O95150 251 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CST4P01036 141 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF17P17021 662 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF429Q86V71 674 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EXTL1Q92935 676 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IER2Q9BTL4 223 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1CBP62140 327 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2A2Q6IF42 318 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEFB108BQ8NET1 73 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR119Q8TDV5 335 aa13.4□□□□□ -0.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RREB1Q92766 1687 aa13.4□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LMO7DNF2Z398 122 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PEX11BO96011 259 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q8IYB0 196 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PMP22Q01453 160 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADGRG7Q96K78 797 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXB1Q99853 325 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MMP25Q9NPA2 562 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FUT3P21217 361 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POM121L2Q96KW2 1035 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRRX2Q99811 253 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NKX2-2O95096 273 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HPP00738 406 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WNT1P04628 370 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5I1Q13606 314 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1J1Q8NGS3 322 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFT2D2O95562 160 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCD3P28288 659 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAG2P55895 527 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MPPED2Q15777 294 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRTM1Q86UE6 522 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKR7LQ8NHP1 331 aa13.39□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SHISA7A6NL88 538 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBP1P09467 338 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FCER1GP30273 86 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCR2P41597 374 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WNT3P56703 355 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR38Q5JTN6 314 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPICQ8N5J4 248 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEFB123Q8N688 67 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CMBLQ96DG6 245 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBTB25P24278 435 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MIDNQ504T8 468 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CADM4Q8NFZ8 388 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC61Q9BV99 259 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 J3QR89 54 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MPGP29372 298 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST3GAL2Q16842 350 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF24Q9Y225 148 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5H15A6NDH6 313 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5H1A6NKK0 313 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C2CD4DB7Z1M9 353 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AVPR2P30518 371 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF117Q03924 483 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GUK1Q16774 197 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCK1Q9HA47 277 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMED3Q9Y3Q3 217 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRYABP02511 175 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf35Q6ZS72 473 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OCIAD1Q9NX40 245 aa13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.37□□□□□ -0.27
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DOK1Q99704 481 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms