RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P2RY10O00398 339 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXH1O75593 365 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHRS3O75911 302 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP6V1B1P15313 513 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAHP16930 419 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EGR1P18146 543 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMRTC1Q5HYR2 192 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR82Q6UXN9 313 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTL8AQ9BWD3 113 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP26Q9NRE1 261 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIGLQ9Y2B2 252 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A8MXK9 166 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C3orf80F5H4A9 247 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDIPTO14735 213 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS2P15880 293 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDONQ4KMG0 1287 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZSR3 168 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITFG2Q969R8 447 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q96MT0 163 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCB9Q9NP78 766 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIOXQ9UGB7 285 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNG8Q9UK08 70 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 V9GYS6 101 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0G2JMP0 313 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0X1KG70 313 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DAPL1A0PJW8 107 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNTNA6NMZ2 147 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGALS8O00214 317 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLIC3O95833 236 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCL1P22362 96 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMB10P40306 273 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTC1P68032 377 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTA1P68133 377 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ODF4Q2M2E3 257 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP78Q5JTW2 689 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB37Q5TC79 503 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF170Q96K19 258 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OOEPA6NGQ2 149 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPT2P23786 658 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR12D2P58182 307 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ESCO2Q56NI9 601 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR38Q5JTN6 314 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF691Q5VV52 312 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF841Q6ZN19 808 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACBD7Q8N6N7 88 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC29Q8WV35 223 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C8orf4Q9NR00 106 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATRQ13535 2644 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM210A6NLX4 147 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFHR2P36980 270 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIR3DL2P43630 455 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPM6AP51674 278 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAX2Q02962 417 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX36Q5VZQ5 186 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM42Q69YG0 159 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MOB3CQ70IA8 216 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM90A1Q86YD7 464 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCCPDHQ8NBX0 429 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF649Q9BS31 505 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTSZQ9UBR2 303 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms