RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK2P20151 261 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ARRDC1Q8N5I2 433 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NUBPLQ8TB37 319 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCFQ9NPI8 374 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SFT2D2O95562 160 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL4P13236 92 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 NAT1P18440 290 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PGAP1Q75T13 922 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf63A6NC05 138 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM231Q9H6L2 316 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HPF1Q9NWY4 346 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTBN2O15020 2390 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 QDPRP09417 244 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY4P51582 365 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM200AQ86VY9 491 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF141Q8WVD5 230 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PLN8 166 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR3A2P47893 321 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SVBPQ8N300 66 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL11Q969Q4 196 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10C1Q96KK4 312 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PISDQ9UG56 409 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 F8W036 122 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MFNGO00587 321 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2J2O76002 312 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRA1P23415 457 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGDSP41222 190 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 BLOC1S1P78537 153 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTBL2Q562R1 376 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QL2Q7Z5L3 287 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51F2Q8NH61 342 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF43P17038 809 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10A2Q9H208 303 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB18Q9NP72 206 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CD79AP11912 226 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 FPR2P25090 351 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA6P31267 233 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC6Q99741 560 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TREM1Q9NP99 234 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM100Q9NV29 134 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB32Q13637 225 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DOK3Q7L591 496 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 KMT5CQ86Y97 462 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 EHFQ9NZC4 300 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RARRES3Q9UL19 164 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF726A6NNF4 738 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB5P09067 269 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms