RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HTR1DP28221 377 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SERPINB8P50452 374 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RPL14P50914 215 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RAB9AP51151 201 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CTBP2P56545 445 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM258P61165 79 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 QRFPP83859 136 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SP4Q02446 784 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ART3Q13508 389 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MESDQ14696 234 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TPSAB1Q15661 275 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC36A2Q495M3 483 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM155Q4W5P6 130 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C6orf52Q5T4I8 152 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GPR107Q5VW38 600 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC80Q76M96 950 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DRAM1Q8N682 238 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZDHHC22Q8N966 263 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 WDR31Q8NA23 367 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 Q8NFD4 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR10P1Q8NGE3 313 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR8S1Q8NH09 359 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPACA4Q8TDM5 124 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HAUS1Q96CS2 278 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DTD2Q96FN9 168 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSPAN32Q96QS1 320 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KCNK16Q96T55 309 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GABRG3Q99928 467 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SH3GL1Q99961 368 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM117Q9H0C3 514 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LRRN3Q9H3W5 708 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CNIH4Q9P003 139 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NPTNQ9Y639 398 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CACNA1AO00555 2505 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MROH7Q68CQ1 1323 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LCTP09848 1927 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MYH11P35749 1972 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TNXBP22105 4242 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 A0A087WX48 190 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 F5H5P2 479 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GOLGA8SH3BPF8 625 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CLOCKO15516 846 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SYNGR1O43759 233 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPOPO43791 374 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LANCL1O43813 399 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SMPD2O60906 423 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SEC22BO75396 215 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AQP8O94778 261 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PSKH1P11801 424 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MYL9P24844 172 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRSS3P35030 304 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KRT20P35900 424 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 P2RY1P47900 373 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RND2P52198 227 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF90Q03938 601 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GLO1Q04760 184 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ADIGQ0VDE8 80 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ITIH4Q14624 930 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MEP1BQ16820 701 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LINC01620Q4KN68 170 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM42Q69YG0 159 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LINC00696Q6ZRV3 163 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDIK1LQ8N165 341 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC35F6Q8N357 371 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR52M1Q8NGK5 317 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 OR5H2Q8NGV7 314 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SFXN5Q8TD22 340 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms