RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COMTD1Q86VU5 262 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AMN1Q8IY45 258 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLPP5Q8NEB5 264 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5C1Q8NGR4 320 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASB13Q8WXK3 278 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UFD1Q92890 307 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSFY1Q96LI6 401 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAT9Q9BTE0 207 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AICDAQ9GZX7 198 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIXL1Q9H2W2 232 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRO3102Q9H379 93 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VCPKMTQ9H867 229 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMAN1LQ9HAT1 526 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GNT2Q9NY97 397 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HAO2Q9NYQ3 351 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR52Q9Y2T5 361 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC42Q9Y546 428 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TEX14Q8IWB6 1497 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELP1O95163 1332 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC7Q96NW7 1537 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MADDQ8WXG6 1647 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC100509620A0A075B734 347 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FUOMA2VDF0 154 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC22A20A6NK97 555 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 F6UB75 175 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTN3A3O00478 584 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH2D1BO14796 132 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLOCKO15516 846 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BEST1O76090 585 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCR2O95944 276 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGF1P05019 195 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FABP3P05413 133 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GKN3PP0CG01 181 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABOP16442 354 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRPRP30550 384 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINB6P35237 376 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCK1P35558 622 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ETV6P41212 452 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEK3P51956 506 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAMP2P63027 116 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACTG1P63261 375 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTN3A2P78410 334 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCRN3Q0VDG4 424 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSPAN31Q12999 210 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTN1A1Q13410 526 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BIRC2Q13490 618 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DMC1Q14565 340 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRYMQ14894 314 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1orf141Q5JVX7 400 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIGD3Q6B0B8 471 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF493Q6ZR52 646 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MREGQ8N565 214 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEFB123Q8N688 67 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR11H7Q8NGC8 314 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC7A13Q8TCU3 470 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC51Q96ER9 411 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC35G5Q96KT7 338 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRC1Q96MC2 740 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DERL1Q9BUN8 251 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NTMT1Q9BV86 223 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF167Q9H6Y7 350 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 INIPQ9NRY2 104 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANAPC5Q9UJX4 755 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STK38LQ9Y2H1 464 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STARD10Q9Y365 291 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PP64 1363 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KANK1Q14678 1352 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CUX1P39880 1505 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYOM1P52179 1685 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAAR5O14804 337 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFLARO15519 480 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTI1O43156 1089 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCO1O75880 301 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CIAO1O76071 339 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR4F21O95013 312 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNK2O95069 426 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA8HP0CJ92 632 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD28P10747 220 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LIPCP11150 499 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPX2P18283 190 aa-2.68□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms