RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 COX5AP20674 150 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 ASCL1P50553 236 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 FZD5Q13467 585 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 AKR1C3P42330 323 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 TFF2Q03403 129 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZNX1 250 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 OR5AP2Q8NGF4 316 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 OR51I2Q9H344 312 aa20.07■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 POU2F2P09086 479 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 YIPF6Q96EC8 236 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 XKRY2A2RUG3 117 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 CYC1P08574 325 aa20.03■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa20.03■□□□□ 0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 CLEC5AQ9NY25 188 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 COX7A1P24310 79 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 OR8B4Q96RC9 309 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 CTDSP1Q9GZU7 261 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 G3V3Q6 166 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 VMA21Q3ZAQ7 101 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM10O14672 748 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 ICMTO60725 284 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-13P01766 116 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-7P01780 117 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF17P17021 662 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK14Q6IE38 97 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-201ENST00000332175 OR10D3Q8NH80 312 aa20.02■□□□□ 0.8
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