RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y8G0 127 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CST4P01036 141 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR5G3P0C626 314 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL6Q8NI99 470 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF586Q9NXT0 402 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 EPPINO95925 133 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 HEXAP06865 529 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CTRB1P17538 263 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZP3P21754 424 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CTRB2Q6GPI1 263 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SPICQ8N5J4 248 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MARVELD1Q9BSK0 173 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CHEK1O14757 476 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CISD3P0C7P0 127 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 EMP3P54852 163 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MPPED2Q15777 294 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM88Q6PEY1 159 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ERGIC1Q969X5 290 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RAB18Q9NP72 206 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ATP23Q9Y6H3 246 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RREB1Q92766 1687 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 G3V3Q6 166 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 AMER3Q8N944 861 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 NECAP1Q8NC96 275 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 EID2BQ96D98 161 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CHRDL1Q9BU40 450 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1456Q9P272 454 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TTC3P53804 2025 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL2Q16842 350 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM18Q96B42 140 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM11P17152 192 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ3P48549 501 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 Q8IYB0 196 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 NMES1Q9C002 83 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TO15178 435 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 OR5V1Q9UGF6 321 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A6P12236 298 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ALG1L2C9J202 215 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM4P0C7M7 580 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1A3P0DMM9 295 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1A4P0DMN0 295 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 NTNG2Q96CW9 530 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZG16BQ96DA0 208 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SCO1O75880 301 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CTDSP1Q9GZU7 261 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SPP1P10451 314 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 KISS1Q15726 138 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TCTN1Q2MV58 587 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PIAS2O75928 621 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FABP6P51161 128 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS2Q13268 280 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CDONQ4KMG0 1287 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CTAG2O75638 210 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 PGA3P0DJD8 388 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF141Q15928 474 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 VN1R1Q9GZP7 353 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A4P12235 298 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GNG3P63215 75 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GSG1Q2KHT4 349 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 MOB1BQ7L9L4 216 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SERGEFQ9UGK8 458 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 YIF1AO95070 293 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CYC1P08574 325 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB25P24278 435 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CADM4Q8NFZ8 388 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 M0R1B8 84 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS3O75911 302 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CCL7P80098 99 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CYTIPO60759 359 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 FABP9Q0Z7S8 132 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 CMBLQ96DG6 245 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01565O15544 149 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms