RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 COL19A1Q14993 1142 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR1L3Q8NH93 324 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 KPTNQ9Y664 436 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CLN5O75503 358 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 FAM27BQ5VT28 67 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PXT1Q8NFP0 134 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 C4orf45Q96LM5 186 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RAB40CQ96S21 281 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 THYN1Q9P016 225 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 LIPT2A6NK58 231 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SNCGO76070 127 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ZFPL1O95159 310 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MT-ND4P03905 459 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 HTD2P86397 168 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 KISS1Q15726 138 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PIGTQ969N2 578 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CLDN23Q96B33 292 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 AKR7A2O43488 359 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 WDR1O75083 606 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 DMWDQ09019 674 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 COTL1Q14019 142 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PTP4A1Q93096 173 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 HSF4Q9ULV5 492 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 C20orf202A1L168 122 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 P2RY10O00398 339 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TSPAN2O60636 221 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PTHLHP12272 177 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GZMHP20718 246 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GZMKP49863 264 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 FXYD4P59646 89 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GUK1Q16774 197 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PATE1Q8WXA2 126 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MED20Q9H944 212 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RNF122Q9H9V4 155 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CALHM2Q9HA72 323 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 A0A0B4J2A0 478 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 M0R296 226 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 FBXO45P0C2W1 286 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CT45A6P0DMU7 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CT45A5P0DMU8 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CT45A7P0DMV0 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PSMB3P49720 205 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 BAMBIQ13145 260 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 IL13RA2Q14627 380 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ERGIC1Q969X5 290 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MARC2Q969Z3 335 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CHST5Q9GZS9 411 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MIDNQ504T8 468 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ZNF766Q5HY98 468 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RTTNQ86VV8 2226 aa5.66□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CBY3A6NI87 242 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PPP1R2P9O14990 202 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CYTIPO60759 359 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 F10P00742 488 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 LIMS3P0CW19 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 LIMS4P0CW20 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TLE1Q04724 770 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ALX3O95076 343 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR8U8P0C7N1 319 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms