RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 PRKYO43930 277 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CIB2O75838 187 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GYPAP02724 150 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMB10P40306 273 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 POU4F2Q12837 409 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GCSAMQ8N6F7 178 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM216AQ8WUB2 273 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC29Q8WV35 223 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 NDUFA2O43678 99 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 NPY4RP50391 375 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 IL5RAQ01344 420 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF841Q6ZN19 808 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR86Q86TI4 376 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 COMMD2Q86X83 199 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 OR1M1Q8NGA1 313 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8B12Q8NGG6 310 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM81AQ8TBF8 368 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MROQ9BYG7 248 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TTTY10Q9BZA0 68 aa24.15■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC182A6NF36 153 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF850A8MQ14 1090 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 M0R129 80 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FCGR1AP12314 374 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CSNK2BP67870 215 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PRDX4Q13162 271 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CD276Q5ZPR3 534 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KCTD8Q6ZWB6 473 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TCEANCQ8N8B7 351 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PIGCQ92535 297 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RTL8AQ9BWD3 113 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ESM1Q9NQ30 184 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CTSZQ9UBR2 303 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 IKZF2Q9UKS7 526 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MPC1Q9Y5U8 109 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa24.14■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ENSAO43768 121 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 EGR1P18146 543 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM90A1Q86YD7 464 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 LRTOMTQ8WZ04 291 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF391Q9UJN7 358 aa24.13■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PPIAL4GP0DN37 164 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ACKR3P25106 362 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FGF12P61328 243 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SLX4IPQ5VYV7 408 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DEGS2Q6QHC5 323 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf53Q8IXP5 236 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 GALNT4Q8N4A0 578 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC22Q8N966 263 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ASB17Q8WXJ9 295 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 UPRTQ96BW1 309 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 LYZL4Q96KX0 146 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.12■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAV40A0A0B4J280 105 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 C22orf46C9J442 243 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CDIPTO14735 213 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 LHBP01229 141 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 GMFBP60983 142 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MICBQ29980 383 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KDM4DQ6B0I6 523 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ITPKCQ96DU7 683 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DUX5Q96PT3 197 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 IL4I1Q96RQ9 567 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCB9Q9NP78 766 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa24.11■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZAR1LA6NP61 321 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TMPRSS2O15393 492 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 EPHA2P29317 976 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RIDAP52758 137 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 UBA52P62987 128 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 BAMBIQ13145 260 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR82Q6UXN9 313 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DOK3Q7L591 496 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM163Q8TC26 289 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF170Q96K19 258 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PKP2Q99959 881 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PCGF1Q9BSM1 259 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SMURF1Q9HCE7 757 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 COPS3Q9UNS2 423 aa24.1■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ACOD1A6NK06 481 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC22A31A6NKX4 558 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF254O75437 659 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CST4P01036 141 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP2K3P46734 347 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MTNR1AP48039 350 aa24.09■■□□□ 1.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms