RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.07■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 SPICQ8N5J4 248 aa16.07■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.07■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.07■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 NIPAL2Q9H841 368 aa16.07■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 RGCCQ9H4X1 137 aa16.05■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 COPS3Q9UNS2 423 aa16.05■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.04■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.04■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 OR8S1Q8NH09 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 Q8TCH9 128 aa16.03■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 CITED1Q99966 193 aa16.03■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 S100A14Q9HCY8 104 aa16.03■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.03■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.02■□□□□ 0.16
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SGMS1-208ENST00000608287 MNTQ99583 582 aa16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM165Q9HC07 324 aa16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 CLN6Q9NWW5 311 aa16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SGMS1-208ENST00000608287 A6NLC8 198 aa16.01■□□□□ 0.15
SGMS1-208ENST00000608287 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.01■□□□□ 0.15
SGMS1-208ENST00000608287 PHYHO14832 338 aa16.01■□□□□ 0.15
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