RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ASH2LQ9UBL3 628 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 BOLA1Q9Y3E2 137 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM4BO94953 1096 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-1P01715 115 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2F2P13984 249 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf35Q96D05 121 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 DLL4Q9NR61 685 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 DHHO43323 396 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 HPXP02790 462 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN1LWP04000 364 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 CD74P04233 296 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GIPP09681 153 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 UBBP0CG47 229 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MPZP25189 248 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF84P51523 738 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 QRFPP83859 136 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GALK2Q01415 458 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PMPCAQ10713 525 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 STEAP1BQ6NZ63 245 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TINAGQ9UJW2 476 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0U1RQV5 110 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS44E7EML9 344 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRM2P08172 466 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCL3P19876 107 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CARD17Q5XLA6 110 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 AQP3Q92482 292 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 FLVCR2Q9UPI3 526 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPB11Q9Y547 144 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2QL1A1L167 161 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PTHLHP12272 177 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 GNALP38405 381 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CX3CR1P49238 355 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0J9YW62 118 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 TBPP20226 339 aa22.25■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CDAP32320 146 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP6P55212 293 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RAP2BP61225 183 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SULF2Q8IWU5 870 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51E1Q8TCB6 317 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC107Q8WV48 283 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 MARVELD3Q96A59 401 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 GHRLQ9UBU3 117 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 MGAT4AQ9UM21 535 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM14DPA8MWL7 114 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2A4O95047 310 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PRF1P14222 555 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD52P43351 418 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF627Q7L945 461 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR2A7Q96R45 310 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 GINS4Q9BRT9 223 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF416Q9BWM5 594 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNHIT1O43257 154 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 LMX1BO60663 402 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP1P22413 925 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 DNASE1P24855 282 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 MPPED2Q15777 294 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF260Q3ZCT1 412 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM27BQ5VT28 67 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 BEST4Q8NFU0 473 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52N4Q8NGI2 321 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A8Q9NY64 477 aa22.23■■□□□ 1.15
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