RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 PPP1CBP62140 327 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TNK1Q13470 666 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 DOC2BQ14184 412 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 NEDD8Q15843 81 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TIGD6Q17RP2 521 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 WDR38Q5JTN6 314 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 RNLSQ5VYX0 342 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 XAF1Q6GPH4 301 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF544Q6NX49 715 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 COMMD2Q86X83 199 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SPARTQ8N0X7 666 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR5M11Q96RB7 305 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR10A2Q9H208 303 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SP140LQ9H930 580 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM206AQ9NX38 181 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 FZR1Q9UM11 496 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 STARD10Q9Y365 291 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.23□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 P2RY10O00398 339 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PSMB9P28065 219 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 DCTDP32321 178 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 THBS4P35443 961 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 KIR3DL2P43630 455 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PTH2RP49190 550 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 MALLQ13021 153 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SPHARQ15513 63 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 REEP6Q96HR9 211 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD4L-218ENST00000587547 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 ACOD1A6NK06 481 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 E7EQL1 145 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 XRCC2O43543 280 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 INMTO95050 263 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF205O95201 554 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 TTRP02766 147 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 SMIM18P0DKX4 95 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 CELP19835 753 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 PCMT1P22061 227 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 GCH1P30793 250 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 MPV17P39210 176 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 TGM4P49221 684 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 FABP6P51161 128 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 TAS2R43P59537 309 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF92Q03936 586 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC3A1Q07837 685 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 CDK5R1Q15078 307 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD4L-218ENST00000587547 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.21□□□□□ -1.26
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