RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	B4GALT1	P15291	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF43	P17038	809 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CRABP2	P29373	138 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CRAT	P43155	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	HNF4G	Q14541	408 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	THRSP	Q92748	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SDF2	Q99470	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SORL1	Q92673	2214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1B0GW55	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234		M0R3G1	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	MANBA	O00462	879 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	NPFF	O15130	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX3	O60493	162 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FZD7	O75084	574 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	STX11	O75558	287 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FGF2	P09038	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CCL2	P13500	99 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ARRB2	P32121	409 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	MPV17	P39210	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXA1	P55317	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	GGH	Q92820	318 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SSX3	Q99909	188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF121	Q9H920	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRIM25-208	ENST00000574234	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A096LPI6	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234		A8MVM7	634 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRIM25-208	ENST00000574234	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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