RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	CFLAR	O15519	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ADAM20	O43506	726 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10H3	O60404	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GLRA3	O75311	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IFNA6	P05013	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GSTA2	P09210	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	KITLG	P21583	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SSTR1	P30872	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	WNT5A	P41221	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HPCA	P84074	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NAB1	Q13506	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		Q6ZR03	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		H3BQF6	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LGALS8	O00214	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CHST1	O43916	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GLCE	O94923	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	IL7R	P16871	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TAC1	P20366	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BDKRB2	P30411	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GRPR	P30550	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BMX	P51813	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686		A8MT66	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	DVL1	O14640	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	C6orf47	O95873	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SOAT1	P35610	550 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	HPCAL1	P37235	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SERPINB8	P50452	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	PUDP	Q08623	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	NPTX1	Q15818	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	RORB	Q92753	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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