RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CDIPT	O14735	213 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFB3	O43676	98 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC22	O60826	627 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CLU	P10909	449 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNGR2	P38484	337 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DDOST	P39656	456 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	TGM4	P49221	684 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CX3CR1	P49238	355 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	GMFB	P60983	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	REEP6	Q96HR9	211 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DHRS12	A0PJE2	317 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR37	O15354	613 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	GMNN	O75496	209 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	TIPRL	O75663	272 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PAH	P00439	452 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	FABP3	P05413	133 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	FMO3	P31513	532 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CRMP1	Q14194	572 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DGUOK	Q16854	277 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	FBLN7	Q53RD9	439 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf50	Q8WW18	174 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	IL20	Q9NYY1	176 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	CD300A	Q9UGN4	299 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-231	ENST00000551931		H3BUX3	64 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OPN1MW	P04001	364 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SPI1	P17947	270 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRA5	P31644	462 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GSK3A	P49840	483 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	EFNB2	P52799	333 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MXRA7	P84157	204 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HERPUD1	Q15011	391 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZPA2	131 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM57B	Q71RH2	274 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	AMELY	Q99218	206 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77

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