RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	DYSF	O75923	2080 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ISPD	A4D126	451 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SYT7	O43581	403 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	LILRA1	O75019	489 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	RP2	O75695	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GNAO1	P09471	354 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANOS1	P23352	680 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GATA4	P43694	442 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDH15	P55291	814 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	OR12D2	P58182	307 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	RORB	Q92753	470 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	JAM3	Q9BX67	310 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518		Q9H521	79 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518		A6NLC8	198 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	P2RY10	O00398	339 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CST4	P01036	141 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC159	P0C7I6	412 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PSMB10	P40306	273 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GZMK	P49863	264 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCR9	P51686	369 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MVK	Q03426	396 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRDX4	Q13162	271 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYL12B	O14950	172 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SERPINA3	P01011	423 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	IGLV3-1	P01715	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GRP	P07492	148 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYF6	P23409	242 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ACKR3	P25106	362 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518		Q8TCH9	128 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	GGH	Q92820	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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