RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-208ENST00000538923 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 FANK1Q8TC84 345 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 ST8SIA4Q92187 359 aa7.31□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 FAM162AQ96A26 154 aa7.31□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 LHBP01229 141 aa7.3□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.3□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 COPS4Q9BT78 406 aa7.29□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.29□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 GADD45GO95257 159 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 NCK1P16333 377 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 GABRA5P31644 462 aa7.28□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
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MRE11-208ENST00000538923 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 HERPUD1Q15011 391 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 WDR38Q5JTN6 314 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MRE11-208ENST00000538923 C11orf88Q6PI97 169 aa7.28□□□□□ -1.24
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