RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 M6PRP20645 277 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CNR1P21554 472 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SVBPQ8N300 66 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 D2HGDHQ8N465 521 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 NUBPLQ8TB37 319 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 NEURL2Q9BR09 285 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 LALBAP00709 142 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 LGALS4P56470 323 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 RAC1P63000 192 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 APH1BQ8WW43 257 aa9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 A0A0A6YYJ9 748 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 LINC01387J3KSC0 135 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CYB5BO43169 146 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 MPZL1O95297 269 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SELEP16581 610 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CHATP28329 748 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 GZMKP49863 264 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SLC37A1P57057 533 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 BAXQ07812 192 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ETFDHQ16134 617 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ARTNQ5T4W7 220 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HES3Q5TGS1 186 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 DEGS2Q6QHC5 323 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR4S1Q8NGB4 309 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR1J1Q8NGS3 322 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR10D3Q8NH80 312 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 MALSU1Q96EH3 234 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PFDN5Q99471 154 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 GHRLQ9UBU3 117 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 EDARQ9UNE0 448 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR5H14A6NHG9 310 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 A8MXE2 369 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 M0R1B8 84 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 FOXS1O43638 330 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HLA-HP01893 362 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HBE1P02100 147 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR4E1P0C645 316 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PATE4P0C8F1 98 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ZNF32P17041 273 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 FOXL2P58012 376 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 FUT7Q11130 342 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SSPNQ14714 243 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 LINC00303Q3SY05 128 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 DRAM2Q6UX65 266 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PCNX1Q96RV3 2341 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 KRBOX1C9JBD0 128 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PSMB6P28072 239 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CLDN20P56880 219 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ESCO2Q56NI9 601 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ZNF766Q5HY98 468 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OSR2Q8N2R0 312 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 OR13C8Q8NGS7 320 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TMED6Q8WW62 240 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 RNF32Q9H0A6 362 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CT45A8P0DMV1 189 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CT45A9P0DMV2 189 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TBPP20226 339 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ZNF92Q03936 586 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CDC20Q12834 499 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HES1Q14469 280 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TESK1Q15569 626 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 CT45A2Q5DJT8 189 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 TMUB2Q71RG4 321 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PXT1Q8NFP0 134 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 MCHR2Q969V1 340 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 ZNF416Q9BWM5 594 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 PLPP3O14495 311 aa8.99□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 HPNP05981 417 aa8.99□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 AADACP22760 399 aa8.99□□□□□ -0.97
GGA3-201ENST00000537686 SRD5A2P31213 254 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms