RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OGFOD2Q6N063 350 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q96M85 177 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT4Q9H2B2 425 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED31Q9Y3C7 131 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPE2 198 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PR64 198 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PRV1 198 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS37A4D1T9 235 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDHDO14521 159 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LDLRAD4O15165 306 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFI30P13284 250 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR3A4PP47883 348 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC9A3P48764 834 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPP10Q8N608 796 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIPHQ8WWY8 451 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STMN2Q93045 179 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNFT2Q96EX2 444 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPH5 198 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2AT4A6NND4 320 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF1BP20333 461 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNALP38405 381 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC1A6P48664 564 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENTPD1P49961 510 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYNLT3P51808 116 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H3AP68431 136 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC23BQ15437 767 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDNFQ8TB73 568 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SORT1Q99523 831 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATF6BQ99941 703 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP57Q9NU63 452 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLKQ9UBE8 527 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HERC1Q15751 4861 aa8.03□□□□□ -1.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SORL1Q92673 2214 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ODF3BA8MYP8 253 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R135 149 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMY1AP04745 511 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMY2AP04746 511 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDO1P14902 403 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC6A1P30531 599 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPTEP56180 551 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MXRA7P84157 204 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF273Q14593 569 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAVSQ7Z434 540 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OAFQ86UD1 273 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00471Q8N535 108 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.02□□□□□ -1.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.02□□□□□ -1.13
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