RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.51□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.5□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GABARAPH6UMI1 98 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TRIM77I1YAP6 450 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 I3L521 148 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 M0R233 179 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AIPO00170 330 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PGRMC2O15173 223 aa3.5□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 SULT1B1O43704 296 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR1F1O43749 312 aa3.5□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 LY6G6DO95868 133 aa3.5□□□□□ -1.85
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SGCE-211ENST00000522045 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF3P17036 446 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CTRB1P17538 263 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CXCL3P19876 107 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRKACBP22694 351 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CALCRP30988 508 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LCN1P31025 176 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MPIP34949 423 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 P2RY2P41231 377 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MAP3K8P41279 467 aa3.5□□□□□ -1.85
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