RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517132.1

RNA5SP340-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 340, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP340, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP340-201ENST00000517132 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 LHX4Q969G2 390 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ITPKCQ96DU7 683 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 JMJD8Q96S16 334 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CCL13Q99616 98 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CHIAQ9BZP6 476 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MUC13Q9H3R2 512 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 COPS3Q9UNS2 423 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 BAIAP2Q9UQB8 552 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 A0A0U1RQK1 487 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FAM181BA6NEQ2 426 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ZNF850A8MQ14 1090 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ZNF879B4DU55 563 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CDIPTO14735 213 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 AKR7A2O43488 359 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 XRCC2O43543 280 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TIPRLO75663 272 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 RHBDL1O75783 438 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TOX4O94842 621 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FSTL3O95633 263 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MELTFP08582 738 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 H2BFMP0C1H6 154 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PPIAL4GP0DN37 164 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 OSMP13725 252 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PAX6P26367 422 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 HSD11B1P28845 292 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 DAPP51397 102 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MNAT1P51948 309 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CBX1P83916 185 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PRDX4Q13162 271 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 IKZF1Q13422 519 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 APOFQ13790 326 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TEX36Q5VZQ5 186 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 SPATA24Q86W54 205 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 BATF2Q8N1L9 274 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ARHGAP24Q8N264 748 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 OR8S1Q8NH09 359 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 OTOSQ8NHW6 89 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ST8SIA4Q92187 359 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PIGCQ92535 297 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ERGIC1Q969X5 290 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PGAM5Q96HS1 289 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 LRGUKQ96M69 825 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 WDFY2Q96P53 400 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PKP2Q99959 881 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ZNF747Q9BV97 191 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 SIRT7Q9NRC8 400 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FAM53CQ9NYF3 392 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ERVK-18Q9QC07 812 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 POMPQ9Y244 141 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 LRP12Q9Y561 859 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 A6NIN4 97 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 AQP12BA6NM10 295 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 SRRM5B3KS81 715 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 H3BSH0 61 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CLDN34H7C241 214 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 GNGT2O14610 69 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PRKYO43930 277 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 E2F6O75461 281 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 IGHV1-69P01742 117 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 IGHV4-59P01825 116 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 LYNP07948 512 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 ALOX5APP20292 161 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 DCTDP32321 178 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 SLC15A1P46059 708 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FOXL1Q12952 345 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FLOT2Q14254 428 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 DGUOKQ16854 277 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 CEP78Q5JTW2 689 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 GPR157Q5UAW9 335 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 STUMQ69YW2 141 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 C16orf87Q6PH81 154 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 Q6YL49 198 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 SSX6Q7RTT6 188 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP340-201ENST00000517132 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms