RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 LIMS3P0CW19 117 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 LIMS4P0CW20 117 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL1P22362 96 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 Q6ZSR3 168 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8S1Q8NH09 359 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 MYDGFQ969H8 173 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 C18orf12Q96KH6 178 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A13Q9Y226 551 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 TPRKBQ9Y3C4 175 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS13CQ709C8 3753 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 HLA-DPB1P04440 258 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ISG15P05161 165 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 TGM4P49221 684 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC58Q4VC31 144 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR38Q5JTN6 314 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52N1Q8NH53 320 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL17Q92583 94 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 HPS1Q92902 700 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 YIPF5Q969M3 257 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 C10orf35Q96D05 121 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 MICU1Q9BPX6 476 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC30A6NM36 301 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 F5H5P2 479 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 H0YL77 283 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 H7C1Q1 480 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC1A7O00341 560 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT7O43581 403 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 XPNPEP2O43895 674 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC14BO60729 498 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 USF1P22415 310 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ACKR3P25106 362 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMB10P40306 273 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 AHSA2Q719I0 299 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB1CQ92928 201 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 FKBP14Q9NWM8 211 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 V9GYS6 101 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF223E7ERA6 249 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LYNX1G3V0Z9 82 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 P2RY10O00398 339 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LYNX1P0DP58 116 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ETV1P50549 477 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH15P55291 814 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RNLSQ5VYX0 342 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R14AQ96A00 147 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 BPESC1Q9GZL8 116 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 GCM1Q9NP62 436 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FRRS1LQ9P0K9 344 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PIGLQ9Y2B2 252 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 DYSFO75923 2080 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1B0GTI1 187 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM212A6NML5 194 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CNBD2Q96M20 576 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RTL8AQ9BWD3 113 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 COMMD4Q9H0A8 199 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM106BQ9NUM4 274 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 IRF2P14316 349 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CHN2P52757 468 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PRDX4Q13162 271 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 MAB21L1Q13394 359 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 Q8TCH9 128 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PIGCQ92535 297 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TECTBQ96PL2 329 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM36Q9NQ86 728 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 BABAM2Q9NXR7 383 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 F8P00451 2351 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM210A6NLX4 147 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 MYL12BO14950 172 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK1P06493 297 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-212ENST00000508338 HEXAP06865 529 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms