RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 DOK3Q7L591 496 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 RDH10Q8IZV5 341 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52N1Q8NH53 320 aa11.39□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.39□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF12P17014 697 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 ACKR3P25106 362 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 CCR9P51686 369 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 HFEQ30201 348 aa11.37□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.37□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 HHLA2Q9UM44 414 aa11.37□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 ACHEP22303 614 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP2K4P45985 399 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 DSCR9P59020 149 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 CDK5R1Q15078 307 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC58Q4VC31 144 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.36□□□□□ -0.59
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