RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 ICAM4Q14773 271 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR8G1Q15617 311 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DOK3Q7L591 496 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 WDR86Q86TI4 376 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 FGFRL1Q8N441 504 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 C3orf56Q8N813 242 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR2T4Q8NH00 348 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 Q8TCH9 128 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 COPS4Q9BT78 406 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MRI1Q9BV20 369 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CENPMQ9NSP4 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NDE1Q9NXR1 346 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 A0A1B0GW55 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DHRS12A0PJE2 317 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 GGT3PA6NGU5 568 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 LRRC30A6NM36 301 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 IFNL4K9M1U5 179 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SFTPBP07988 381 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 PSMB10P40306 273 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 BAMBIQ13145 260 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 PCK2Q16822 640 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MICAQ29983 383 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DRAM2Q6UX65 266 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DHFR2Q86XF0 187 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR2T33Q8NG76 320 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR2T29Q8NH02 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SPTSSAQ969W0 71 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 UPRTQ96BW1 309 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NUDT11Q96G61 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NSL1Q96IY1 281 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 OR8B2Q96RD0 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 KCNJ15Q99712 375 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 REEP1Q9H902 201 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 DUX4Q9UBX2 424 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CLN8Q9UBY8 286 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 MIOXQ9UGB7 285 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF878C9JN71 531 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-209ENST00000502575 GRPP07492 148 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 HKR1P10072 659 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 IRF2P14316 349 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 PRTN3P24158 256 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 FMO3P31513 532 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CX3CR1P49238 355 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SLC25A1P53007 311 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 FGF12P61328 243 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 CSNK2BP67870 215 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 TAF13Q15543 124 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 KLHL12Q53G59 568 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-209ENST00000502575 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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