RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RRASP10301 218 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPMP14384 443 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 HPGDP15428 266 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GALP22466 123 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL32P24001 234 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRD5A2P31213 254 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD79BP40259 229 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAGEB1P43366 347 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAG2P55895 527 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB38P57729 211 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PUDPQ08623 228 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ST3GAL3Q11203 375 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB40BQ12829 278 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 BIKQ13323 160 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MADCAM1Q13477 382 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL18Q14116 193 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAM2Q15035 370 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTB4RQ15722 352 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYPL1Q16563 259 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACKR1Q16570 336 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC36A2Q495M3 483 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 EIPR1Q53HC9 387 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEFB123Q8N688 67 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF614Q8N883 585 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 COX18Q8N8Q8 333 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RFT1Q96AA3 541 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ART5Q96L15 291 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBP7Q96R05 134 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR7D2Q96RA2 312 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RASL10BQ96S79 203 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPA33Q99795 319 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASCL2Q99929 193 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC61Q9BV99 259 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PINK1Q9BXM7 581 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPA2Q9H2U2 334 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR51J1Q9H342 316 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 UCK1Q9HA47 277 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LHX9Q9NQ69 397 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MED9Q9NWA0 146 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDR45Q9Y484 360 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 NPTNQ9Y639 398 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 LAMA3Q16787 3333 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP290O15078 2479 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A087X002 238 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 TLCD2A6NGC4 264 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 LMO7DNF2Z398 122 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 G3V3Q6 166 aa3.46□□□□□ -1.86
TIMMDC1-209ENST00000498399 H0YIG0 161 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms