RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		B4E171	279 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	DNPH1	O43598	174 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	DHRS3	O75911	302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PMP2	P02689	132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	CALCR	P30988	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	TSPAN7	P41732	249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PHB2	Q99623	299 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		V9GYS6	101 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MASP2	O00187	686 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	APOC1	P02654	83 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	HLA-G	P17693	338 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	IL13RA1	P78552	427 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	KISS1	Q15726	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1W2PP11	408 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		P04436	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MPG	P29372	298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SRD5A2	P31213	254 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM50B	P56557	158 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	FRYL	O94915	3013 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		M0R135	149 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MFNG	O00587	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	GP1BA	P07359	652 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	NMB	P08949	121 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ICAM2	P13598	275 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PTGFR	P43088	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	TAS2R31	P59538	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RAC3	P60763	192 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	MICB	Q29980	383 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		Q6ZSR3	168 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522		A0A0D9SG52	128 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	CCS	O14618	274 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	EFS	O43281	561 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	RAD51D	O75771	328 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	SLC25A4	P12235	298 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF250	P15622	560 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OTX2	P32243	289 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CALD1-222	ENST00000495522	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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