RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 VSIG4Q9Y279 399 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 OR14I1A6ND48 311 aa11.31□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 HRH1P35367 487 aa11.31□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 A0A087WZY1 265 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 NTF4P34130 210 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.66e-14■□□□□ 8.8
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PRAME-213ENST00000492657 NAXDQ8IW45 347 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 DEFB123Q8N688 67 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 NABP1Q96AH0 204 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 TMEM41AQ96HV5 264 aa11.3□□□□□ -0.6
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