RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491295.1

GGA1-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 4

Gene GGA1, Length 594 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-223	ENST00000491295	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TIMM23	O14925	209 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	CLU	P10909	449 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GNAL	P38405	381 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	RELB	Q01201	579 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	IL5RA	Q01344	420 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	LCN8	Q6JVE9	175 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	WDR82	Q6UXN9	313 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	DHFR2	Q86XF0	187 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ST8SIA4	Q92187	359 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	CITED1	Q99966	193 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	MICU1	Q9BPX6	476 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ABHD6	Q9BV23	337 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	NDUFB3	O43676	98 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GLCE	O94923	617 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GSTT1	P30711	240 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	IER3	P46695	156 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GSK3A	P49840	483 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GUCA2A	Q02747	115 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295		M0QZ24	198 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	FCN3	O75636	299 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	SOX14	O95416	240 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ATP6V1B2	P21281	511 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	OPRL1	P41146	370 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	TGM4	P49221	684 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	DEFA6	Q01524	100 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	POU4F2	Q12837	409 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	WDR38	Q5JTN6	314 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	BRICD5	Q6PL45	260 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	FAM57B	Q71RH2	274 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	WDR86	Q86TI4	376 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	CCL13	Q99616	98 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	RNF114	Q9Y508	228 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295		U3KQV3	271 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GGA1-223	ENST00000491295	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295		B2RBV5	119 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	GPR137B	O60478	399 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	CLPX	O76031	633 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	FBP1	P09467	338 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	H2BFM	P0C1H6	154 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	KLHL12	Q53G59	568 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	TIGD4	Q8IY51	512 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	MED30	Q96HR3	178 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	PGAM5	Q96HS1	289 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	NIPAL2	Q9H841	368 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295		A0A0U1RQK1	487 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295		H3BN98	237 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	CDIPT	O14735	213 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	CST4	P01036	141 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	RAP2A	P10114	183 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	STUM	Q69YW2	141 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	OTOS	Q8NHW6	89 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GGA1-223	ENST00000491295	LINC01006	Q8NI28	216 aa		14.76	□□□□□ -0.05

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