RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 ASB5Q8WWX0 329 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ST8SIA4Q92187 359 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A28Q96A46 364 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SEH1LQ96EE3 360 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 CXorf58Q96LI9 332 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00052Q96N35 136 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OXGR1Q96P68 337 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR5B2Q96R09 309 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DKKL1Q9UK85 242 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAB22AQ9UL26 194 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 MAST4O15021 2626 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SULT2B1O00204 365 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LDLRAD4O15165 306 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAMP1O60894 148 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 SCO1O75880 301 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TSPAN9O75954 239 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 BPNT1O95861 308 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PTHLHP12272 177 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 KLK2P20151 261 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 HSD11B1P28845 292 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 STARP49675 285 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TNFSF10P50591 281 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 EFNB2P52799 333 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RAC3P60763 192 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 GUCA2AQ02747 115 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PMPCAQ10713 525 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 HIST3H3Q16695 136 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF546Q86UE3 836 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 OR1S1Q8NH92 325 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ST8SIA2Q92186 375 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FAM46BQ96A09 425 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PHB2Q99623 299 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD6Q9BV23 337 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 RASL12Q9NYN1 266 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 LRP12Q9Y561 859 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 ACACAQ13085 2346 aa8.46□□□□□ -1.05
POLR1A-208ENST00000486964 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR14I1A6ND48 311 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 GJE1A6NN92 205 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 H0YC42 278 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TSPAN4O14817 238 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 KDM4BO94953 1096 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 VAMP5O95183 116 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SFTPDP35247 375 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CCL11P51671 97 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS2Q13268 280 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PCK2Q16822 640 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 RAET1LQ5VY80 246 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 LYG2Q86SG7 212 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR8S1Q8NH09 359 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR6X1Q8NH79 312 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 AQP3Q92482 292 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 RELTQ969Z4 430 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 AMELYQ99218 206 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PIGMQ9H3S5 423 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms