RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 SLC22A4Q9H015 551 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TOR3AQ9H497 397 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 AURKCQ9UQB9 309 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MEIOCA2RUB1 952 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NME4O00746 187 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 BHLHE40O14503 412 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ARPC3O15145 178 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GSTA4O15217 222 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PIN1P1O15428 100 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RENP00797 406 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 HLA-DQA2P01906 255 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GABRA5P31644 462 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KIR2DS4P43632 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GSK3BP49841 420 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 LOXL3P58215 753 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GMFBP60983 142 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 IKZF1Q13422 519 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FGD3Q5JSP0 725 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZTK2 550 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SPERTQ8NA61 448 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MRAPQ8TCY5 172 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CFHR4Q92496 578 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SGK3Q96BR1 496 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR52D1Q9H346 318 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 BTBD17A6NE02 478 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 H3BUX3 64 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CDIPTO14735 213 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFB3O43676 98 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF823P16415 610 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RHCEP18577 417 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SAA4P35542 130 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC7A2P52569 658 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FAM3AP98173 230 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MICBQ29980 383 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 WDR82Q6UXN9 313 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 LILRB2Q8N423 598 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PIFOQ8TCI5 191 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SPTSSAQ969W0 71 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FAM162AQ96A26 154 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SPSB4Q96A44 273 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SSX3Q99909 188 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 IFT27Q9BW83 186 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CENPMQ9NSP4 180 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PAHP00439 452 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV1-40P01703 118 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CD28P10747 220 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FSTP19883 344 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A6P31641 620 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2E1P51965 193 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ERVFRD-1P60508 538 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MAPRE2Q15555 327 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DGUOKQ16854 277 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL12Q53G59 568 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 STUMQ69YW2 141 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GLYATQ6IB77 296 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms