RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GWJ7	208 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880		H3BNX3	289 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880		J3QLI3	93 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PHYH	O14832	338 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	BAG2	O95816	211 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	AVP	P01185	164 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GATA3	P23771	443 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PITPNB	P48739	271 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK2B	P67870	215 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	POU4F2	Q12837	409 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	KCNJ8	Q15842	424 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF404	Q494X3	552 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	NANP	Q8TBE9	248 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880		Q8TCH9	128 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC29	Q8WV35	223 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	STMN2	Q93045	179 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ADAM20	O43506	726 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF254	O75437	659 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GYPA	P02724	150 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	KRT8	P05787	483 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	WNT2	P09544	360 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	EPHA1	P21709	976 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K3	P46734	347 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	IL5RA	Q01344	420 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CBR4	Q8N4T8	237 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RNF170	Q96K19	258 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	LYZL4	Q96KX0	146 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GPR84	Q9NQS5	396 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CLN6	Q9NWW5	311 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	FAM206A	Q9NX38	181 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	AUP1	Q9Y679	476 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OOEP	A6NGQ2	149 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PRR32	B1ATL7	298 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		H3BSH0	61 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS8	O00214	317 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CDIPT	O14735	213 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ACKR3	P25106	362 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	HTR1F	P30939	366 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ALDH3A2	P51648	485 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF154	Q13106	437 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ODF4	Q2M2E3	257 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CEP78	Q5JTW2	689 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RFK	Q969G6	155 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MNT	Q99583	582 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	S100A14	Q9HCY8	104 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ALPL	P05186	524 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	EGR1	P18146	543 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ROM1	Q03395	351 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MOB3C	Q70IA8	216 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PHC2	Q8IXK0	858 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43

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