RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OR8B3Q8NGG8 313 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OR8B2Q96RD0 313 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CLN6Q9NWW5 311 aa20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 LGALS8O00214 317 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 TCF21O43680 179 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ALPLP05186 524 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CD80P33681 288 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CDC42P60953 191 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 GNB2P62879 340 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 IL5RAQ01344 420 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 LIPNQ5VXI9 398 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 COMMD2Q86X83 199 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 NANPQ8TBE9 248 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 APOL4Q9BPW4 351 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 MICU1Q9BPX6 476 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 USE1Q9NZ43 259 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OPN4Q9UHM6 478 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 DNHD1Q96M86 4753 aa20.04■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0U1RQV5 110 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 C3orf80F5H4A9 247 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF12P17014 697 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 HTR1FP30939 366 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 PITPNBP48739 271 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 PRDX4Q13162 271 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ8Q15842 424 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 LYPD2Q6UXB3 125 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 WDR86Q86TI4 376 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 OR1M1Q8NGA1 313 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 PIGCQ92535 297 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 INSIG2Q9Y5U4 225 aa20.03■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CST4P01036 141 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 EPHA1P21709 976 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 MAP2K3P46734 347 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH3A2P51648 485 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 POU4F2Q12837 409 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF154Q13106 437 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CBR4Q8N4T8 237 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 GCSAMQ8N6F7 178 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ITPKCQ96DU7 683 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 TBX5Q99593 518 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 RTL8AQ9BWD3 113 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 S100A14Q9HCY8 104 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 ABCB9Q9NP78 766 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 CLN8Q9UBY8 286 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.02■□□□□ 0.8
SMKR1-201ENST00000462322 STAB1Q9NY15 2570 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 DOCK11Q5JSL3 2073 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 OOEPA6NGQ2 149 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6V1E1P36543 226 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK2BP67870 215 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 EGR3Q06889 387 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 PHC2Q8IXK0 858 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC29Q8WV35 223 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 RFKQ969G6 155 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 EME1Q96AY2 570 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 MRI1Q9BV20 369 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 GPR84Q9NQS5 396 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 AUP1Q9Y679 476 aa20.01■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 APOL3O95236 402 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 LHBP01229 141 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 OR5P3Q8WZ94 311 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R14AQ96A00 147 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 HRASLS5Q96KN8 279 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 R4GMQ9 66 aa20■□□□□ 0.79
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms