RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-208	ENST00000454619	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	NME4	O00746	187 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	SLC22A2	O15244	555 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	SLC2A1	P11166	492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	GSK3B	P49841	420 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	PRKX	P51817	358 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	CSNK2B	P67870	215 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	TAF13	Q15543	124 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	KCNJ15	Q99712	375 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NME4-208	ENST00000454619		A0A1W2PQ09	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	TBX1	O43435	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SMIM11A	P58511	58 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	LY6E	Q16553	131 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	AANAT	Q16613	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	MED30	Q96HR3	178 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CDIPT	O14735	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	FBXO24	O75426	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	DIRAS1	O95057	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SELL	P14151	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NCK1	P16333	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	AMY2B	P19961	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	PYCR1	P32322	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	GNAL	P38405	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	IFNGR2	P38484	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	FAM3A	P98173	230 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SNCB	Q16143	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SP140L	Q9H930	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	GADD45G	O95257	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SPARC	P09486	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	PSKH1	P11801	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	NDUFB7	P17568	137 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	POU1F1	P28069	291 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SLC15A1	P46059	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ENTPD1	P49961	510 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CAV3	P56539	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	IL5RA	Q01344	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	SPIB	Q01892	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	FTMT	Q8N4E7	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	RORB	Q92753	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NME4-208	ENST00000454619	GAFA1	Q96PS6	74 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms