RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAPPC2LH3BP13 241 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 M0R129 80 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMD9O00233 223 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDUFA2O43678 99 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HCCSP53701 268 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C12orf73Q69YU5 71 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR8B12Q8NGG6 310 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTTY10Q9BZA0 68 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF319Q9P2F9 582 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.58□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACOD1A6NK06 481 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EBAG9O00559 213 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAM20O43506 726 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V1E1P36543 226 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP2K3P46734 347 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPY4RP50391 375 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRDX4Q13162 271 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD276Q5ZPR3 534 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFP1Q6P2D0 407 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASRGL1Q7L266 308 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC29Q8WV35 223 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGCQ92535 297 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR8B4Q96RC9 309 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OPN4Q9UHM6 478 aa13.57□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM210A6NLX4 147 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM77I1YAP6 450 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EPHA2P29317 976 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCTDP32321 178 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC42P60953 191 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CXCR4P61073 352 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POU4F2Q12837 409 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP43Q70EL4 1123 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C22orf15Q8WYQ4 148 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC6A7Q99884 636 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUP50Q9UKX7 468 aa13.56□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0U1RQV5 110 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ENSAO43768 121 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VENTXO95231 258 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CST4P01036 141 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT8P05787 483 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V1B1P15313 513 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACTG1P63261 375 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ROM1Q03395 351 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MICBQ29980 383 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCSAMQ8N6F7 178 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR8J1Q8NGP2 316 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RFKQ969G6 155 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITFG2Q969R8 447 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF170Q96K19 258 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PKP2Q99959 881 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GABARAPL3Q9BY60 117 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PBOV1Q9GZY1 135 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLN6Q9NWW5 311 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM206AQ9NX38 181 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COPS3Q9UNS2 423 aa13.55□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDIPTO14735 213 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMPRSS2O15393 492 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GYPAP02724 150 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMB10P40306 273 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HILS1P60008 231 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSNK2BP67870 215 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EGR3Q06889 387 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL2L15Q5TBC7 163 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITPKCQ96DU7 683 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LYZL4Q96KX0 146 aa13.54□□□□□ -0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms