RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 WDR82Q6UXN9 313 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 ZNF454Q8N9F8 522 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 THEM6Q8WUY1 208 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 RGCCQ9H4X1 137 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 PRODHO43272 600 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 E2F6O75461 281 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 TOX4O94842 621 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 SLC2A5P22732 501 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 ITPKCQ96DU7 683 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 WDFY2Q96P53 400 aa22.54■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.54■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa22.53■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.53■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 ACKR3P25106 362 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 FLOT2Q14254 428 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 MICBQ29980 383 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 C16orf87Q6PH81 154 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 SPATA24Q86W54 205 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 FGFRL1Q8N441 504 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 SEH1LQ96EE3 360 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 LYZL4Q96KX0 146 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 SIRPDQ9H106 197 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 DUX4Q9UBX2 424 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 MGAM2Q2M2H8 2515 aa22.53■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 GYG2O15488 501 aa22.52■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 ANXA8P13928 327 aa22.52■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 GNALP38405 381 aa22.52■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 SLC35D3Q5M8T2 416 aa22.52■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 ZDHHC16Q969W1 377 aa22.52■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 CDIPTO14735 213 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 IL13RA1P78552 427 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 WDR38Q5JTN6 314 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 Q6YL49 198 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 CCL13Q99616 98 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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LMO1-202ENST00000428101 SLC25A19Q9HC21 320 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 POMPQ9Y244 141 aa22.51■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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LMO1-202ENST00000428101 IL5RAQ01344 420 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 SNCBQ16143 134 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 FTMTQ8N4E7 242 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 ST8SIA4Q92187 359 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 MICU1Q9BPX6 476 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 NOX4Q9NPH5 578 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 LRP12Q9Y561 859 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.5■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 ANXA2P2A6NMY6 339 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 CST4P01036 141 aa22.49■■□□□ 1.19
LMO1-202ENST00000428101 AMY2BP19961 511 aa22.49■■□□□ 1.19
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