RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.93□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0YL77 283 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSTL3O95633 263 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DPB1P04440 258 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa12.93□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISG15P05161 165 aa12.92□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.92□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf35Q96D05 121 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM80Q96HE8 168 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MICU1Q9BPX6 476 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FN3KRPQ9HA64 309 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNG2Q9Y698 323 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 V9GYS6 101 aa12.92□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GTI1 187 aa12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa12.91□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS35Q8N3Z0 413 aa12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa12.91□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMB10P40306 273 aa12.9□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf141Q5SZD1 244 aa12.9□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR14K1Q8NGZ2 314 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52N1Q8NH53 320 aa12.9□□□□□ -0.34
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.9□□□□□ -0.34
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